По данным Департамента государственного контроля и перспективного развития в сфере природопользования и охраны окружающей среды МПР РФ по УрФО (ДГК по УрФО), характерными загрязняющими веществами поверхностных вод округа являются нефтепродукты, фенолы, аммиак, соединения меди, цинка, марганца, железа.

Особую угрозу для водоемов Обь-Иртышского бассейна представляют нефтепродукты, на долю которых приходится до 80% общего загрязнения в ХМАО и ЯНАО. Это связано с тем, что добыча и транспортировка нефти сопровождается загрязнением окружающей среды, в том числе и водных систем.

В 2002 г. специалистами ДГК по УрФО проверено 266 предприятий-водопользователей, выявлено 734 нарушения природоохранного законодательства, устранено 426 нарушений. В ходе проверок были вынесены постановления о взыскании штрафов на общую сумму 2.045,3 тыс. руб., взыскано 930,6 тыс. руб., предъявленная сумма ущерба составила 585,96 тыс. руб., оплаченная – 27,056 тыс. руб. Передано 11 дел в правоохранительные органы, МНС и органы, выдававшие лицензии.

Основными нарушениями, выявленными в ходе проверок, являются: превышение нормативов ПДС (ВСС) загрязняющих веществ, поступающих в водные объекты со сточными водами предприятий; самовольное пользование водными объектами; нарушение условий лицензий, выданных на водопользование; строительство объектов без положительного заключения государственной экологической экспертизы по проектной документации.